{"id":1058,"date":"2015-04-21T19:01:44","date_gmt":"2015-04-21T23:01:44","guid":{"rendered":"http:\/\/monbug.jplaverdure.ca\/?p=1058"},"modified":"2021-04-11T11:04:58","modified_gmt":"2021-04-11T15:04:58","slug":"reunion-du-mois-de-mai","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/monbug.ca\/fr\/reunion-du-mois-de-mai\/","title":{"rendered":"R\u00e9union du mois de mai"},"content":{"rendered":"

Merci d’avoir assist\u00e9 si nombreux \u00e0 notre r\u00e9union du 7 mai, en d\u00e9bit du temps superbe et du match de hockey.
\nUn merci tout particulier aux trois excellents pr\u00e9sentateurs, et \u00e0 notre nouveau commanditaire, Illumina.<\/p>\n

Nous esp\u00e9rons avoir des pr\u00e9sentateurs de tr\u00e8s haut calibre pour nos prochaines r\u00e9unions, donc\u00a0nous esp\u00e9rons vous y voir nombreux.
\nAussi, n’h\u00e9sitez pas \u00e0 nous contacter \u00e0 info@monbug.ca si vous voulez vous porter volontaire pour une pr\u00e9sentation.
\nNous allons annoncer l’agenda de la r\u00e9union de juin d\u00e8s que la liste de pr\u00e9sentateurs est finalis\u00e9e, donc restez \u00e0 l’\u00e9coute. \ud83d\ude42<\/p>\n

Agende de la r\u00e9union du 7 mai (Agenda de la r\u00e9union de juin \u00e0 suivre)<\/strong><\/p>\n

Vous pouvez vous inscrire \u00e0 http:\/\/www.meetup.com\/monbug<\/a>, ou en nous envoyant un courriel \u00e0 inscription@monbug.ca, si vous pr\u00e9f\u00e9rez.<\/p>\n

Nous voulons souhaiter la bienvenue \u00e0 notre nouveau parrain, Illumina! Plus de 90% des donn\u00e9es d’ADN produites \u00e0 ce jour proviennent de machines Illumina (Regalado, 2014). Nous allons bient\u00f4t annoncer des projets collaboratifs avec Illumina, notamment sur le Illumina BaseSpace.<\/p>\n

Encore une fois, nous avons trois excellents pr\u00e9sentateurs.
\nDavid Bujold va pr\u00e9senter le portail GenAP<\/a>, qui sera bient\u00f4t un outil essentiel pour toute personne faisant des analyses g\u00e9nomiques au Canada.
\nNadia Tahiri va pr\u00e9senter sa recherche sur le d\u00e9veloppement de nouveaux algorithmes pour construire des arbres phylog\u00e9n\u00e9tiques.
\nNehme Hachem va pr\u00e9senter son analyse bioinformatique des impacts des substances chimiques sur la sant\u00e9 humaine, d’une perspective toxicog\u00e9nomique.<\/p>\n

Nous avons d\u00e9lib\u00e9r\u00e9ment choisi d’avoir des pr\u00e9sentations et des r\u00e9unions courtes. Si voulez poursuivre la discussion apr\u00e8s la r\u00e9union, vous \u00eates les bienvenus.<\/p>\n

16:00 – 16:10<\/strong>\u00a0Introduction, et questions, commentaires ou annonces des participants, Alexis Blanchet-Cohen
\n16:10 – 17:00<\/strong>\u00a0\u00ab\u00a0Am\u00e9liorer l’accessibilit\u00e9 aux outils bioinformatiques via le portail GenAP\u00a0\u00bb, David Bujold (McGill)
\n17:00 – 17:15<\/strong>\u00a0Rafra\u00eechissements et collations
\n17:15 – 17:45<\/strong>\u00a0\u00ab\u00a0Algorithmes bioinformatiques pour la reconstruction d’arbres consensus et de super-arbres multiples\u00a0\u00bb, Nadia Tahiri (UQAM)
\n17:45 – 18:00<\/strong>\u00a0\u00ab\u00a0D\u00e9terminer l’impact des substances chimiques sur la sant\u00e9 humaine d’une perspective toxicog\u00e9nomiqe\u00a0\u00bb, Nehme Hachem (IRCM)<\/p>\n

R\u00e9sum\u00e9 de la pr\u00e9sentation sur le portail GenAP de David Bujold (traduit de l’anglais)<\/p>\n

\u00ab\u00a0Puisque les pipelines d’analyse de GenAP ont d\u00e9j\u00e0 \u00e9t\u00e9 le sujet d’une pr\u00e9sentation \u00e0 MonBUg, cette pr\u00e9sentation portera sur le portail Web de GenAP.<\/p>\n

Le portail GenAP (\u00ab\u00a0Genetics and Genomics Analysis Platform\u00a0\u00bb) est une plateforme en-ligne con\u00e7ue pour les chercheurs en sciences de la vie. Les objectifs du portail sont de rendre plus accessibles les analyses bioinformatiques et le partage de donn\u00e9es aux non-bioinformaticiens, et r\u00e9duire les embouteillages associ\u00e9s aux traitements de donn\u00e9es g\u00e9nomiques. Pour atteindre ces objectifs, GenAP fournit une interace Web avec des outils d’analyse conviviaux qui tirent avantage des ressources de Calcul Canada, comme un miroir UCSC Genome Browser et le portail de donn\u00e9es IHEC.\u00a0\u00bb<\/p>\n

R\u00e9sum\u00e9 de la pr\u00e9sentation sur les arbres phylog\u00e9n\u00e9tiques par Nadia Tahiri<\/p>\n

\u00ab\u00a0Nous pr\u00e9senterons de nouveaux algorithmes permettant d\u2019affiner l\u2019inf\u00e9rence d\u2019arbres consensus et de super-arbres obtenus par regroupement d\u2019arbres phylog\u00e9n\u00e9tiques (i.e., arbres additifs ou X-arbres). L\u2019avantage de notre approche par rapport \u00e0 l\u2019approches classique, qui retournent toujours un arbre unique (i.e., arbre consensus ou super-arbre), est que nos algorithmes proposent comme solution un ou plusieurs arbres (i.e., arbre consensus ou super-arbre) d\u00e9pendamment des topologies d\u2019arbres fournies en entr\u00e9e. Nous utilisons l\u2019algorithme des k-moyennes pour obtenir le partitionnement optimal de l\u2019ensemble des arbres consid\u00e9r\u00e9s. Nous appliquerons les algorithmes propos\u00e9s pour analyser de nombreux jeux de donn\u00e9es r\u00e9elles et simul\u00e9es.\u00a0\u00bb<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

Merci d’avoir assist\u00e9 si nombreux \u00e0 notre r\u00e9union du 7 mai, en d\u00e9bit du temps superbe et du match de hockey. Un merci tout particulier aux trois excellents pr\u00e9sentateurs, et \u00e0 notre nouveau commanditaire, Illumina. Nous esp\u00e9rons avoir des pr\u00e9sentateurs de tr\u00e8s haut calibre pour nos prochaines r\u00e9unions, donc\u00a0nous esp\u00e9rons vous y voir nombreux. Aussi, […]<\/p>\n","protected":false},"author":3,"featured_media":0,"comment_status":"closed","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[13,5],"tags":[],"class_list":{"0":"post-1058","1":"post","2":"type-post","3":"status-publish","4":"format-standard","6":"category-activites-monbug","7":"category-page-accueil"},"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/monbug.ca\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/1058","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/monbug.ca\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/monbug.ca\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/monbug.ca\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/users\/3"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/monbug.ca\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=1058"}],"version-history":[{"count":16,"href":"https:\/\/monbug.ca\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/1058\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":2025,"href":"https:\/\/monbug.ca\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/1058\/revisions\/2025"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/monbug.ca\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=1058"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/monbug.ca\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=1058"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/monbug.ca\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=1058"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}