{"id":1528,"date":"2017-12-01T20:21:54","date_gmt":"2017-12-02T01:21:54","guid":{"rendered":"http:\/\/monbug.jplaverdure.ca\/?p=1528"},"modified":"2021-04-11T11:05:14","modified_gmt":"2021-04-11T15:05:14","slug":"joyeuses-fetes-nous-serons-de-retour-en-2018","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/monbug.ca\/fr\/joyeuses-fetes-nous-serons-de-retour-en-2018\/","title":{"rendered":"R\u00e9union du printemps"},"content":{"rendered":"
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Inscrivez-vous \u00e0 http:\/\/meetup.com\/monbug<\/a>, ou en envoyant un courriel \u00e0 inscription@monbug.ca
\nLa prochaine r\u00e9union aura lieu le mercredi 14 mars, de 17:00 \u00e0 18:45 dans la salle Andr\u00e9-Barbeau de l’IRCM.<\/p>\n

MonBUG est de retour, avec l’arriv\u00e9e du printemps!
\nCette r\u00e9union porte enti\u00e8rement sur l’utilisation de R dans les analyses bio-informatiques.<\/p>\n

Mathieu Lajoie, PhD, nous pr\u00e9sentera comment il utilise R dans ses analyses g\u00e9n\u00e9tiques. Selin Jessa, auteur du package R, chromswitch, nous expliquera les \u00e9tapes pour soumettre son propre package \u00e0 Bioconductor, le \u00ab\u00a0d\u00e9p\u00f4t\u00a0\u00bb pour les \u00ab\u00a0packages\u00a0\u00bb bio-informatiques.<\/p>\n

Agenda17:00 – 17:05 Introduction et annonces communautaires
\n17:05 -17:45 \u00ab\u00a0Getting reliable estimates of tumour purity to improve downstream analyses\u00a0\u00bb, Mathieu Lajoie, PhD, Watson lab
\n17:40 – 18:05 Pause, avec collations et rafra\u00eechissements.
\n18:05 – 18:45 An introduction to Bioconductor package development, Selin Jessa, Kleinman lab<\/p>\n

R\u00e9sum\u00e9 de la pr\u00e9sentation de Mathieu (en anglais)
\n\u00ab\u00a0Getting reliable estimates of tumour purity to improve downstream analyses. Solid tumour samples are usually contaminated with a highly variable fraction of infiltrating lymphocytes and stromal cells.In this presentation I will describe different approaches to estimate the cancer cell fraction and discuss how this can impact RNAseq and copy number analysis, using TCGA data. R code snippets included.\u00a0\u00bb<\/p>\n

Nous sommes toujours \u00e0 la recherche de pr\u00e9sentateurs enthousiastes. MonBUG est un forum informel, o\u00f9 les bio-informaticiens peuvent partager leur recherche, alors n’h\u00e9sitez pas \u00e0 vous porter volontaire pour une pr\u00e9sentation.
\nAussi, si vous cherchez un emploi, ou si vous offrez un emploi, c’est un excellent endroit pour faire du r\u00e9seautage. On peut m\u00eame vous laisser le plancher libre au d\u00e9but de la r\u00e9union pour vous vendre si vous voulez.<\/p>\n<\/div>\n<\/div>\n<\/section>\n

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