Novembre - Virginie Calderon, Janosch Ortmann, Steven Hébert¶
Détails de l'évènement
Date/Heure:
Mercredi, 23 novembre 2016 16h00 - 18h00
Lieu:
Emplacement: Auditorium Jacques-Genest, IRCM
Horaire:
16h00 - 16h05 — Introduction et annonces communautaires
16h05 - 16h40 — Virginie Calderon, PhD — « Transmission de l'hépatite C de la mère à l'enfant durant la grossesse, et une nouvelle méthode pour détecter la réassignation de codon dans les génomes » (traduit de l'anglais)
16h40 - 17h00 — Pause avec collations et rafraîchissements
17h00 - 17h30 — Janosch Ortmann, PhD — « Determining the optimality regions of the alignment space »
17h30 - 18h00 — Steven Hébert, MsC — Comment utiliser Docker pour distribuer vos programmes bioinformatiques
Conférencière: Virginie Calderon, PhD
Affiliation: IRCM
Titre de la présentation: Transmission de l'hépatite C de la mère à l'enfant durant la grossesse, et une nouvelle méthode pour détecter la réassignation de codon dans les génomes
Résumé:
Virginie va nous présenter sa recherche durant son post-doc sur la transmission de l'hépatite C de la mère à l'enfant durant la grossesse (avec Dr. Souydens à Ste-Justine), et sa recherche sur une nouvelle méthode pour détecter la réassignation de codon dans les génomes (avec Dr Mabrouk et Dr Lang à l'UdeM, et Dr Blanchette à McGill).
Biographie
Virginie Calderon est la nouvelle responsable du plateau de bio-informatique à l'IRCM. Elle se joint aussi à l'équipe organisatrice de MonBUG.
Conférencier: Janosch Ortmann, PhD
Affiliation: Centre de recherches mathématiques, Université de Montréal
Titre de la présentation: Determining the optimality regions of the alignment space
Résumé:
Il va nous présenter une version vulgarisée de son dernier papier sur le « problème de l'alignement de séquences ». Inviter un mathématicien à MonBUG est une opportunité pour nous d'accroître les collaborations entre les mathématiciens et les bioinformaticiens. Janosch est particulièrement intéressé à savoir si sa recherche peut être utile en génomique, et s'il y a des possibilités de collaboration entre les mathématiciens et les chercheurs en génomique.
Biographie
Janosch Ortmann est un mathématicien, un chercheur post-doctoral au Centre de recherches mathématiques de l'Université de Montréal.
Conférencier: Steven Hébert, MsC
Affiliation: Lady Davis Institute
Titre de la présentation: Comment utiliser Docker pour distribuer vos programmes bioinformatiques
Résumé:
Il va nous présenter Docker, qui est utilisé de plus en plus fréquemment pour distribuer des programmes de bio-informatique dans des environnements différents.
Biographie
Steven Hébert est un analyste en bio-informatique au Lady Davis Institute, dans le labo de Dr. Kleinman.