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Mars - José Héctor Gálvez, Rached Alkallas

Détails de l'évènement

Date/Heure:

Mercredi, 3 mars 2021 16h30

Lieu:

Emplacement: En ligne (Jitsi / YouTube Live)

Horaire:

16:30 — José Héctor Gálvez — Le projet VirusSeq au Centre Génomique de McGill
17:00 — Rached Alkallas — Estimating and controlling for differences in cell type proportions in the analysis of bulk RNA-seq data

Les deux présentations seront en anglais.

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Conférencier: José Héctor Gálvez

Affiliation: Centre Génomique de McGill

Titre de la présentation: Le projet VirusSeq au Centre Génomique de McGill

Résumé:

La conférence donnera un résumé du projet québécois de Séquençage Viral, surtout les pipelines et l’infrastructure bioinformatique nécessaires pour séquencer et génotyper des milliers d’échantillons viraux du SRAS-CoV-2. Les technologies séquençage avec des reads courtes et longues seront discutées, comme les principales différences dans les outils informatiques utilisés pour la détection des variantes et les avantages et les inconvénients de chacune. Finalement, une brève description de la chronologie du projet et les principaux résultats publiés à ce jour sera également présentée.

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Conférencier: Rached Alkallas

Titre de la présentation: Estimating and controlling for differences in cell type proportions in the analysis of bulk RNA-seq data

Résumé:

Rached, qui cherche à cataloguer et à comprendre les altérations moléculaires rencontrées dans les mélanomes cutanés, nous en apprendra davantage sur l’analyse des données issues du séquençage de l’ARN de cellules groupées (bulk RNASeq).

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